(1)進鍋不擠壓：擺放待滅菌的菌種袋必須分層，每層菌種袋不行擺太擠，要留一定空地，不能彼此擠壓。不適宜將菌種袋臥疊，要分層立放，以確保蒸汽暢流和接種穴無缺。為了防止棉塞易潮濕，可在棉塞上蓋一層薄膜或油紙，但掩蓋物不行太大，否則會影響上基層蒸汽暢流;也可將4個菌種袋的棉塞并攏，棉塞向下一同塞到4個菌種袋的空地中，這樣塑料袋標準要加長，但防潮作用杰出。
(2)及時滅菌：隨裝隨滅。配料到滅菌間隔時間越短越好，防止雜菌自繁。大規模出產時，要分鍋滅菌。
(3)攻頭：指開端滅菌時要大火猛燒。從開端滅菌到溫度達100℃，歷時越短越好，不能超過2小時，防止長時間高溫高濕造成雜菌自繁。當然，要做到這一點還取決于滅菌鍋的保溫保氣功能。
(4)控中心：指鍋體下部溫度到達100~C后，控制火勢燒穩火，保持8～10小時。此間，溫度不行回落，滅菌操作者要堅守崗位，不能因通宵滅菌、疲憊或其他原因此松懈，引起溫度回落。另外，常壓滅菌為了防止燒干應留意及時向蒸發鍋內補充水，但補水不能造成鍋內水中止沸騰，可考慮補充沸水或微量接連補水。可見，要想節省燃料，又要做到上述這些，建造一個保溫、保汽功能杰出的滅菌鍋十分重要。
(5)保尾：指滅菌完畢前要再一次大火猛燒。目的在于加大蒸汽量，滅菌完畢后翻開柜門時有大量蒸汽冒出，帶走棉塞濕氣。但此時要將連體滅菌鍋中蒸發鍋內的水排干。在開門時先將門拉開一條縫隙散氣，烘干棉塞，防止冷熱觸摸產生冷凝水使棉塞受潮。
